Должно ли было ТОО, не состоящее на регистрационном учете по НДС, выписывать ЭСФ при реализации товара, включенного в Перечень изъятий? (В. Зубку, 16 августа 2017 г.)

Должно ли было ТОО, не состоящее на регистрационном учете по НДС, выписывать ЭСФ при реализации товара, включенного в Перечень изъятий?
(В. Зубку, аудитор РК, профессиональный бухгалтер РК, САР, 16 августа 2017 г.)

ТОО (малый бизнес) не состояло на учете по НДС, импортировало товар (семена подсолнечника), входящий в Перечень изъятий. Часть товара в апреле-мае 2017 года реализовано без НДС в РК, в июне ТОО становится на учет по НДС и реализовывает оставшийся товар с НДС, выставив электронные счета-фактуры. Должно ли было ТОО выставлять электронные счета-фактуры по товарам, реализованным без НДС? Если да, то какую административную ответственность понесет ТОО? Как известно, размер штрафа выражается в процентном отношении от суммы НДС, в данном случае реализация происходила без учета НДС.

В соответствии с пунктом 7 Инструкции по организации системы учета отдельных товаров при их перемещении в рамках взаимной трансграничной торговли государств-членов Евразийского экономического союза, налогоплательщик выписывает электронный счет-фактуру в порядке, установленном Правилами документооборота счетов-фактур, выписываемых в электронной форме, при:

реализации товаров, включенных в Перечень, которые ранее ввезены с территории третьих стран;

реализации ввезенных на территорию Республики Казахстан с территории государств-членов ЕАЭС товаров, код ТН ВЭД ЕАЭС и наименование включены в Перечень;

при реализации произведенных на территории Республики Казахстан товаров, код ТН ВЭД ЕАЭС, и наименование которых включено в Перечень;