Набор реагентов для выявления мутации в S гене SARS-CoV-2 методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени 7R Bio® SARS-CoV-2 VOC SCREEN. Инструкция по применению медицинского изделия для диагностики in vitro (утверждена приказом Председателя Комитета контроля медицинской и фармацевтической деятельности МЗ РК от 31 марта 2022 года № 050205)

Утверждена

приказом Председателя

Комитета контроля медицинской и

фармацевтической деятельности МЗ РК

от 31 марта 2022 года № 050205

Инструкция

по применению медицинского изделия для диагностики in vitro

1. Наименование медицинского изделия для диагностики in vitro

Набор реагентов для выявления мутации в S гене SARS-CoV-2 методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени 7R Bio® SARS-CoV-2 VOC SCREEN

2. Состав и описание медицинского изделия

Принцип метода

Принцип анализа основан на проведении обратной транскрипции с последующим ПЦР (ОТ-ПЦР) с регистрацией процесса амплификации специфического фрагмента кДНК, включающего выявляемые мутации в гене S вируса SARS-CoV-2. Набор позволяет выявлять мутации N501Y, Р681Н, делецию 69-70del, Е484К, K417N, L452R, 156-157del, P681R, 143-145del и ins214EPE в гене S вируса SARS-CoV-2 как в отдельности, так и интерпретировать результаты в сочетании мутаций для определения генетических линий вируса.

˗ для генетической линии В.1.1.7 (Alpha) SARS-CoV-2 характерно сочетание мутаций N501Y, Р681Н и 69-70del;

˗ для генетических линий В.1.351 (Beta) SARS-CoV-2 характерно сочетание мутаций Е484К, K417N и N501Y;

˗ для генетической линий B.1.617.2 (Delta) SARS-CoV-2 характерно сочетание мутации L452R, 156-157del и P681R.

˗ для генетической линий B.1.1.529 (Omicron) SARS-CoV-2 характерно сочетание мутации Р681Н, N501Y, 69-70del, K417N, 143-145del и ins214EPE.

ОТ-ПЦР позволяет выполнить синтез кДНК вируса SARS-CoV-2 и последующую ее амплификацию последовательно в одной пробирке в стандартизованных условиях. В пробирку с готовой реакционной смесью для ОТ-ПЦР, содержащую внутренний контрольный образец (ВКО) для контроля амплификации, одновременно добавляют ген-специфичные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд для амплификации гена-мишени, и образец выделенной РНК.

Выявление мутаций SARS-CoV-2 для одного образца проводится в четырех пробирках. Анализируют кривые накопления флуоресцентного сигнала по 4 различным каналам:

˗ для FRP-смеси A по каналу FАМ детектируется мутация N501Y, по каналу ROX детектируется делеция 69-70del и по каналу CY5 детектируется мутация Р681R в гене S;

˗ для FRP-смеси B по каналу FАМ детектируется мутация Е484К, по каналу ROX детектируется мутация L452R и по каналу CY5 детектируется мутация P681H в гене S;

˗ для FRP-смеси C по каналу FАМ детектируется делеция 143-145del, по каналу ROX детектируется мутация K417N в гене S;

˗ для FRP-смеси D по каналу FАМ детектируется делеция 156-157del, по каналу ROX детектируется инсерция ins214EPE в гене S.

Набор реагентов «7R Bio® SARS-CoV-2 VOC SCREEN» рассчитан на постановку 96 определений в объеме реакционной смеси 25 мкл, включая контрольные образцы для определения каждой генетической линии.

Возможно проведение 4 независимых постановки ОТ-ПЦР по 24 образца для определения каждой генетической линии, включая контрольные образцы.

Описание реагентов

Объемы реагентов, указанных в перечне, могут иметь допустимую погрешность.